J 2021

Hymenobacter caeli sp. nov., an airborne bacterium isolated from King George Island, Antarctica

ROLDÁN, Diego M., Nikos KYRPIDES, Tanja WOYKE, Nicole SHAPIRO, William B. WHITMAN et. al.

Základní údaje

Originální název

Hymenobacter caeli sp. nov., an airborne bacterium isolated from King George Island, Antarctica

Autoři

ROLDÁN, Diego M., Nikos KYRPIDES, Tanja WOYKE, Nicole SHAPIRO, William B. WHITMAN, Stanislava KRÁLOVÁ (703 Slovensko, domácí), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí), Hans-Jürgen BUSSE a Rodolfo Javier MENES (garant)

Vydání

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2021, 1466-5026

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10606 Microbiology

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 2.689

Kód RIV

RIV/00216224:14310/21:00122071

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000687127500005

EID Scopus

2-s2.0-85108504963

Klíčová slova anglicky

extremophiles; Hymenobacter sp.; maritime Antarctica; psychrophiles; airborne bacteria

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 14. 9. 2021 10:55, Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS.

Anotace

V originále

A rod-shaped and Gram-stain-negative bacterial strain 9AT, was isolated from an air sample collected at King George Island, maritime Antarctica. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequence reveals that strain 9AT belongs to the genus Hymenobacter and shows the highest similarity to Hymenobacter coccineus CCM 8649T (96.8 %). The DNA G+C content based on the draft genome sequence is 64.9 mol%. Strain 9AT is strictly aerobic, psychrophilic, catalase-positive, oxidase-positive and non-motile. Growth is observed at 0–20 °C (optimum 10 °C), pH 6.0–8.0 (optimum pH 7.0), and in the absence of NaCl. The predominant menaquinone of strain 9AT is MK-7 and the major fatty acids comprise Summed Feature 3 (C16 : 1 ω7c and/or C16 : 1 ω6c; 25.2 %), iso-C15 : 0 (23.2 %), C16 : 1 ω5c (11.6 %), Summed Feature 4 (anteiso-C17 : 1 B/iso-C17 : 1 I) (9.6 %) and anteiso-C15 : 0 (9.6 %). The polar lipid profile consists of the major lipid phosphatidylethanolamine and moderate to minor amounts of phosphatidylserine, unidentified aminolipids, aminophospholipids, aminophosphoglycolipids, polar lipids lacking a functional group and an unidentified phospholipid and a glycolipid. In the polyamine pattern sym-homospermidine is predominant. On the basis of the results obtained, strain 9AT is proposed as a novel species of the genus Hymenobacter, for which the name Hymenobacter caeli sp. nov. is suggested. The type strain is 9AT (=CCM 8971T=LMG 32109T=DSM 111653T).