J 2011

Convolution of Large 3D Images on GPU and its Decomposition

KARAS, Pavel a David SVOBODA

Základní údaje

Originální název

Convolution of Large 3D Images on GPU and its Decomposition

Název česky

Konvoluce velkých 3D obrazů na GPU a její dekompozice

Autoři

KARAS, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) a David SVOBODA (203 Česká republika, domácí)

Vydání

EURASIP Journal on Advances in Signal Processing, NEW YORK (USA), HINDAWI PUBLISHING CORPORATION, 2011, 1687-6172

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 1.053 v roce 2010

Kód RIV

RIV/00216224:14330/11:00053127

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

DOI

UT WoS

000300351600001

Klíčová slova česky

konvoluce; dekompozice; fft; gpu; dif; 3D

Klíčová slova anglicky

convolution; decomposition; fft; gpu; dif; 3D

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 16. 5. 2012 13:31, RNDr. Pavel Karas, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

In this paper we propose a method for computing convolution of large 3D images. The convolution is performed in a frequency domain using a convolution theorem. The algorithm is accelerated on a graphic card by means of the CUDA parallel computing model. Convolution is decomposed in a frequency domain using the DIF (decimation in frequency) algorithm. We pay attention to keeping our approach efficient in terms of both time and memory consumption and also in terms of memory transfers between CPU and GPU which have a significant influence on overall computational time. We also study the implementation on multiple GPUs and compare the results between the multi-GPU and multi-CPU implementations.

Česky

Článek se zabývá konvolucí velkých 3D obrazů na grafických kartách a řeší problém pro data, která se nevejdou do paměti GPU.

Návaznosti

LC535, projekt VaV
Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, záměr
Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
MUNI/A/0914/2009, interní kód MU
Název: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace (Akronym: SV-FI MAV)
Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
2B06052, projekt VaV
Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů